講演(2011年)

国際会議

  • Keiji Miura “An unbiased estimator of noise correlations under signal drift”, Japanese Neural Network Society 2011 (Okinawa, Japan, 2011.12.17)
  • S Sawannee and K Kinoshita “A novel biclustering approach with iterative optimization targeting co-expressed gene clusters”, International Conference in Bioinformatics 2011(Kuala Lumpur,?2011.11.30-12.01)
  • A Patil, K Nakai, and K Kinoshita “Assessing the quality of gene co-expression stability in combination with correlation in the analysis of protein-protein interaction networks”,?International Conference in Bioinformatics 2011(Kuala Lumpur,?2011.11.30-12.01)
  • Keiji Miura, Zachary F. Mainen, Naoshige Uchida “Fast, efficient population codes in olfactory cortex through decorrelation and synchronization to theta-frequency sniffing”, Frontiers in Neuroscience: From Brain to Mind (Kyoto, JAPAN, 2011.12.08)
  • Kazuki Nakada, Keiji Miura, Hatsuo Hayashi “Noise-induced Phenomena in a Two Strongly Pulse-coupled Spiking Neuron Models”, 50 Years of Chaos : Applied and Theoretical (Kyoto, JAPAN, 2011.11.30)
  • Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita.?“COXPRESdb: a gene coexpression database for 7 animal species”, International Symposium for 70th anniversary of IDAC, Tohoku University?(Sendai, 2011.11.28)
  • K Kinoshita “Seeing in silico is believing, Brief introduction and some recent topics in bioinformatics”, The 12th, RIES-Hokudai International Symposium(Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo,?2011.11.22)(招待講演)
  • I. N. Motoike “Branching pattern formation with excitation wave propagation”, Mathematical Models of Biological Phenomena and their Analysis(Sendai International Center, 2011.11.21-24)
  • Alice Wang, Keiji Miura, Naoshige Uchida “The dorsomedial striatum, a site for energizing and directing behavior”, Society for Neuroscience ( Washington DC, 2011.11.16)
  • Keiji Miura, Naoshige Uchida “Impact of structured noise correlations on efficacy of population coding”, Society for Neuroscience (Washington DC, 2011.11.15)
  • Keiji Miura “An unbiased estimator of noise correlations under signal drift”, Dynamical Neuroscience XIX (Washington DC, 2011.11.10)
  • M Shirota and K Kinoshita “Illuminating the background and capabilities of statistical potentials of protein structures”, The 11th KIAS Conference on Protein Structure and Function (Seoul, Korea,?2011.10.06-08)(招待講演)
  • Keiji Miura “An unbiased estimator of noise correlations under signal drift”, Neuroscience 2011 (Yokohama, Japan, 2011.09.16)
  • Keiji Miura “An unbiased estimator of noise correlations under signal drift”, International Exchange Meeting for Young Researchers at Neuroscience 2011 (Yokohama, Japan, 2011.09.14)
  • K. Kasahara and K Kinoshita “Universal patterns of protein-ligand interactions: Gaussian mixture model analyses on 3D structure of proteins in Protein Data Bank, International Society for Computational Biology(Vienna Austria,?2011.07.18)
  • Keiji Miura “Application of information geometry to neuroeconomics”,?International Council for Industrial and Applied Mathematics?2011 (Vancouver, Canada, 2011.07.20)
  • Keiji Miura “An unbiased estimator of noise correlations under signal drift”, EASIAM 2011 (Kitakyushu, Japan, 2011.06.28)
  • K. Kota, K. Kinoshita “Universality of molecular interactions in protein-ligand binding: Gaussian-based analysis on Protein Data Bank”, 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (Austria Center Vienna, 2011.07.18)
  • Takeshi Obayashi ?”How to measure the similarity of gene expression patterns to identify gene function” QBIC2011 Bio-Informatics Workshop (Tokyo university of science, 2011.03.11)(招待講演)

国内会議

  • 三浦佳二?”An unbiased estimator of noise correlations under signal drift”,?日欧先端科学セミナー(フォーシーズンズホテル椿山荘, 2012/2/28)
  • 大林武?「遺伝子共発現ネットワークの比較」東北大学重点プログラム,数学をコアとするスマート・イノベーション融合研究共通基盤の構築と展開,CMRU研究会,ネットワークから見る生命?(東北大学, 2011.12.21-23)
  • 三浦佳二「時間変動するデータから変動しない情報を取り出す数学」越境する数学(東京大学, 2011.12.20)
  • 木下賢吾「生命科学と数学の連携例と今後の課題」数学をコアとするスマートイノベーション(東北大学,?2011.11.29)
  • K Kinoshita “COXPRESdb, A database of gene coexpression in seven model animals”, CBI/JSBi(神戸国際会議場,?2011.11.08)
  • 木下賢吾「ハブタンパク質の構造的基盤」学際ライフサイエンスシンポジウム(加齢医学研究所,?2011.11.01)
  • 岡村容伸,大林武,木下賢吾「ヒトとマウスの遺伝子発現パターンの比較解析」第25回生体生命工学研究会?(東北大学, 2011.10.26)
  • 大林武, 木下賢吾「遺伝子共発現の計算法ならびに計算に必要なマイクロアレイのサンプル数」第3回生命情報科学若手の会研究会?(岡崎, 2011.10.15-16)
  • 笠原浩太, 木下賢吾 “All-against-all comparisons of protein-ligand interactions by using a Gaussian mixture model-based pattern recognition technique”, 日本生物物理学会第49回年会(兵庫県立大学, 2011.09.17)
  • 城田松之, 石田貴士, 木下賢吾, 「天然構造のデータのみから構築されたタンパク質モデル構造の絶対的な質の評価法」第49回日本生物物理学会年会, (兵庫県立大学,?2011.09.16-18)
  • 元池N.育子 “3-dimensional branching path formation with discrete reaction-diffusion model”, 第49回日本生物物理学会年会(兵庫県立大学, 2011.09.16-18)
  • 今村(滝川)寿子, 元池N.育子 “Dendritic gates for the signal integration with the excitability-dependent responsiveness”, 第21回日本数理生物学会年会(明治大学, 2011.09.13-15)
  • Takeshi Obayashi “Gene coexpression analysis to explore real gene network” 18th Marine Genomics Seminar (OIST, 2011.09.03)(招待講演)
  • 木下賢吾 「遺伝子の機能推定」生物物理学会夏の学校(京都セミナーハウス,?2011.08.27)
  • 三浦佳二「イベント発生時刻の不規則性」東北大×北大 数学連携 Summer Institute(札幌, 2011.8.19)
  • 岡村容伸,大林武,木下賢吾「7生物種における遺伝子共発現の比較と保存共発現の有効性」第13回日本進化学会?(京都, 2011.07.29-31)
  • 大林武,木下賢吾「遺伝子共発現データベースCOXPRESdb」第136回加齢研研究員会集談会(加齢医学研究所, 2011.07.02)
  • 木下賢吾「遺伝子の機能推定法の開発」生物物理学会東北支部会(東北大学,?2011.06.17)
  • 木下賢吾「東北大学の震災状況報告」第11回日本蛋白質科学会(ホテル阪急エキスポパーク,?2011.06.09)
  • 本野 千恵, 中田淳一, 清水佳奈, 富井健太郎, 長野希美, 野口保, 廣明秀一, 雨宮崇之, 城田松之, 小池亮太郎, 白井剛, 木下賢吾, 太田元規「ヒトゲノム構造・機能アノテーションデータベースSAHG:高等生物由来タンパク質の構造予測パイプラインの開発とヒト由来全タンパク質への適 用」第11回日本蛋白質科学会(ホテル阪急エキスポパーク,?2011.06.09)
  • 天野剛志, 合田名都子, 岩谷奈央子, 廣明秀一, 木下賢吾, 太田元規「ヒトタンパク質構造データベースSAHGによるドラッガブルなPDZドメインの探索」第11回日本蛋白質科学会(ホテル阪急エキスポパーク,?2011.06.09)
  • 笠原浩太, 木下賢吾,「混合正規分布モデルに基づくタンパク質-低分子リガンド間相互作用の網羅的パターン解析」第11回日本蛋白質科学会(ホテル阪急エキスポパーク,?2011.06.08)
  • 城田松之, 木下賢吾「タンパク質立体構造における4体間相互作用の解析」第11回日本蛋白質科学会(ホテル阪急エキスポパーク,?2011.06.07-09)
  • A Patil, K Kinoshita, H Nakamura, K Nakai “Structural properties of hub proteins in interaction networks and its implications on interaction promiscuity”?第11回日本蛋白質科学会(ホテル阪急エキスポパーク,?2011.06.07)
  • 三浦佳二「イベント発生時刻の不規則性」応用数学連携フォーラム 第18回ワークショップ(仙台, 2011.5.12)
  • 笠原浩太, 木下賢吾「タンパク質-低分子リガンド間相互作用に関する網羅的パターン解析とデータベース開発」日本薬学会第131年会(静岡大学など, 2011.03.30)
  • 木下賢吾「遺伝子共発現を利用した機能関連遺伝子の同定法」日本薬学会(ツインメッセ静岡, 2011.03.29)
  • 末松J.信彦, 佐藤太亮, 元池N.育子, 中田聡「円形反応場を伝播する化学反応波の集団が形成する疎密波」日本化学会第91春季年会(神奈川大学, 2011.03.26-29)
  • 大林武,木下賢吾「ATTED-II ver6:?遺伝子共発現データの条件比較、種間比較」第52回植物生理学会?(仙台, 2011.03.20-22)

その他

  • 木下賢吾「PDBj & eF-siteの紹介」Web service 利用者講習会(東京大学医科学研究所, 2011.10.25)
  • 大林武「共発現データベースCOXPRESdb」HGCスパコンWebサービス利用法講習会?(東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター, 2011.10.25)
  • 大林武「遺伝子発現データの使い方」生命情報科学若手の会・沖縄セミナー (OIST, 2011.09.01-04)
  • 木下賢吾「タンパク質相互社応予測モデル解析演習」(東京大学医科学研究所, 2011.02.03)
  • 木下賢吾「構造からの機能予測法入門」PDBj講習会(長浜バイオ大学, 2011.01.17)
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