議論した点 

・遺伝子の水平伝播はどのような時に起こる

・原核生物の形と環境

・自由エネルギーとは何か？

・ゲノムサイズと遺伝子数の関係は

・深海の生物はどうやって生きているのか

・細菌と古細菌の違い

・ウイルス由来の塩基配列がどうやって伝わるか

・最初は無機栄養生物と光栄養生物のどちらから始まったのか

・なぜ生物のドメインは３つなのか

感想

「細胞の分子生物学」（第五版）を用いて議論するセミナーを始めました． 各節のまとめをラボブログに載せていきたいと思います．

担当：大林武
参加者: 9名
節の概要: 生命共通の仕組み．特に，自己複製を実現するための物理的実体としてのDNA，ならびにDNA→RNA→タンパク質の情報の流れを示す．

議論1　DNA→RNA→タンパク質の情報伝達系の始まり

・（RNA説）RNAウイルスの存在はRNAから始まったことを示唆する．
・（タンパク質説）ヌクレオチドよりもアミノ酸の方が構造が単純．
　・初期の地球環境を模した研究では，いくつかのアミノ酸が自然合成されていた．
・（RNA説）ヌクレオチドを構成する，プリン，ピリミジン，リボースは環構造を持つ．環構造は自由度が小さくなり，また分解されにくいので，他の物質との相互作用が起きやすい．
・（RNA説）炭化水素鎖は膜脂質にも使われており，利用しやすいものかもしれない．そうであれば，リボースは直ぐに作成できそう．

議論2　アミノ酸はなぜ20種類か？

・もし一種類しかなければ，長さでしか情報を表現できない．最低限2種類は必要．
・疎水性アミノ酸は性質の違いが小さく，無くても大丈夫そう．
・最低限なくては困るアミノ酸は数種類しかない
　・疎水性アミノ酸の何か
　・親水性アミノ酸
　・架橋するためのシステイン
　・酸性アミノ酸，塩基性アミノ酸：荷電性物質の選択に必要（イオンやリガンド）．

・コドンとの関連
　・アミノ酸が16種類ならば2塩基コドンで良く，ゲノム配列の節約になる．
　・3塩基コドンならば，最大64種類使うことも可能だが，生合成コストによる制約によって20種類になっている．

議論3　アミノ酸の供給源

・動物はタンパク質を経口摂取
　・アミノ酸は何回でも再利用が可能（劣化しない）
・細菌や植物は外部タンパク質を大量摂取できないので，自前で合成．

議論4　DNAの塩基はなぜ4種類か

・2文字ならば，長いゲノムが必要
・偶数文字でないと，相補対を作れない
　・自分同士で相補対が作れると，奇数文字でも大丈夫．
・AT(2)とGC(3)と異なる2重結合数ペアになっている．
　・塩基の構造を考慮すると，2重結合の数が異なる方がミスが少ない．
　・2種類の結合強度が存在することで，ゲノムの大局的な強度変化を作ることができる．

他の議論点

・mRNAの構造（tRNA, rRNAとの比較）
・DNAは何故2本鎖
・チミンとウラシルを使い分ける理由
・遺伝子と発現調節部位の位置関係

感想

現存する生命体のシステムがどの程度必然であったのかが面白いと思っています．全く同じ原始地球環境を用意したら，全く同じシステムができるのか．重力・光・水などの条件が異なるとどうなるのか．

11月某日
昨年度、我々からの挑戦を受け
かるーく蹴散らしたお隣の研究室、中尾研から挑戦状が届いていました。

良いでしょう。受けて立ちます。

もしかしたら、コンディションが悪いし負けちゃうかもしれないなー
とか思わずに、昨年同様かるーくひねりつぶして差し上げましょう。

11月26日 土曜日
天候にも恵まれ、予定通り駅伝大会が実施されました。

集合時刻の朝9時には、当日出場予定のない朝の弱い写真係が珍しく早く到着し
そのせいか逆に1名ほど遅刻者がでたようですが、点呼には間に合いました。

第一走者がぞくぞくと集まってきています。
中央部で寒さに震えているのが我らが伊藤君です。

予定の10時30分から10分以上寒さに震えながら待ち
やっとこさスタート
伊藤君が写った写真を見つけることができなかったため適当な走り出しの写真

そして第二走者サワニーさんから土多さんへタスキが渡ります！かろうじて土多さんが見える!?

そして第四走者、我らが大林さん。競り合ってます！（木下先生のカメラ綺麗に写るなぁ・・・

待機している笠原さんを激写！

読者の皆様は、お気づきになられるでしょうか。靴なのに5本指であるということが・・・
これがのちに東北大学の歴史に名を刻む、恐怖の5本指スニーカーである・・・

第四走者から第五走者へは中央から離れていたため、撮影することができませんでしたが、
帰ってきた岡村さんをすかさずパチリッ！
完全に風をとらえています。この時、「まだまだ俺は行ける！」と思ったとか思わなかったとか

おや、こんなところに木下先生と奥さまと大林さんの奥さまが

おっと、田高君を発見！
登ってきています。

そして、笠原さんにエアタスキ渡し！

城田さんが帰ってきて

平谷さんがゴール！！

はたして結果は・・・！

大健闘の15位！
そして挑戦状をたたきつけてきたお隣中尾研はどうなったのか・・・

どーん！

17位で我が軍の勝利です！
今年も圧倒的な？差というものを見せつけてやりました。
まぁ17位ですか?早いですよね。うちは15位ですけど。
17位っていったら全参加研究室がいくつでしょう40近くあるなかですし真ん中以上！
来年また頑張って欲しいですね。

木下研は、君たちの挑戦をいつでも待っている！

そしておでん！駅伝とおでんがかかっていたのはこの時知りました。

最後におでん後に屋上で写真撮影
変顔でという指令がでたのですが、一人しかやってないようです。おかしいなぁ

今回、写真が多いので表示に時間がかかってしまうかもしれません。
きっと今の時代光ですよね！Hikari！そんなことを言っていたら怒られますね。

中尾研を煽っていたのも、先輩にやれって言われたんです。怒らないでください。すいませんでした。
僕は中尾研大好き！

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淡い色の変化の紅葉がきれいでした。

温泉街でおいしいものを食べ、仙台へ帰りました。

みなさま合宿お疲れ様でした。

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ちなみに、初日夜にC葉さんが持ってこられたボードゲーム「パンデミック」がすごく面白かったです。

すばらしいゲームバランスでした。

写真提供：笠原さん

文責：沼倉

笠原です。被災しました。
研究室に居たひとは皆無事。4年生1名連絡取れてませんが）、東京に居たはず。
3年生は連絡とれてません。というか携帯電話の連絡先知りません…。見てたらコメント下さい。
仙台市の様子を載せておきます。

まずはじめに

どうも、初投稿のツチダです。

先日の駅伝大会は、東北大に来て一番楽しみにしていた行事なので、14位という好成績には感無量です。この研究室12人全員の努力を、誇りに思っています。