担当：小澤
参加者：8名

概要：
テナガザルのゲノム解析から，種特有トランスポゾンがもつゲノム可塑性を示唆

議論：
系統樹の正当性の考え方


過去は，表現型から系統樹を考えていた
今は，遺伝型から系統樹を定量的に考えることができる

2つの系統樹の間に生まれるギャップをどのように解釈するか


そもそも系統樹とは？
・利用目的によって作り方が違う 使用する種
　祖先の種や年代の推定が可能

・主に最尤法によって計算される
・計算の上で，知識による定義が使われる(分子時計など)

・有根と無根の２種類がある (起源がわかるかどうか)


昔は，表現型から，感覚的な区分しかできなかった
遺伝型からの推測が可能になり，(系統樹内の)葉がもつ配列の進化の歴史が見える
– その上で，変化に対する解釈には，地理的変動などの過去の背景知識が必要
– 最尤法による計算のため，偶発的な同座位への変異経過が見えなくなってしまう
   -> 遺伝型の違いを見るのには問題はないが，進化プロセスを見る点では問題がある